Como agrupamento, a Escola Básica Integrada dos Biscoitos (EBI dos Biscoitos) participou no programa Eco-Escolas e conquistou o respetivo galardão em 2003/2004, em 2012/2013 e em 2013/2014.
Vários dos seus estabelecimentos de ensino (entre os atuais e outros entretanto extintos – EB/JI dos Biscoitos, EB/JI das Quatro Ribeiras) participaram em diversos anos, tendo conquistado vários galardões.